Диагноз ставится на основании опроса родителей о факторах риска и клинического осмотра полости рта с последующим рентгеном.
Дифференциальный диагноз учитывает врожденные отклонения в строении зубов:
- Детская меланодонтия, поражающая, в основном, резцы верхней челюсти.
- Несовершенный амелогенез эмали, наследуемое заболевание дентина, характеризующееся темным, коричневатым цветом зубов и короткими корнями.
- Гипоплазия эмали, возникающая из-за недостатка питания в перинатальный период или дефицита витамина A. Она повышает восприимчивость к кариесу и часто сопутствует бутылочному кариесу.

